Todos los fabricantes de instrumentos incluyen ajustes que permiten escalar los datos para su visualización durante la adquisición. Antes de FCS 3.1, el archivo era el encargado de controlar el escalado de datos. Con FCS 3.1, el software que realiza el análisis es el encargado de controlar el escalado de datos. Con el fin de garantizar que los datos se vean en el software de análisis del mismo modo que durante la adquisición, se deben aplicar las preferencias predeterminadas del instrumento. 

FCS contiene una palabra clave que permite identificar el citómetro empleado para la adquisición. El software de análisis Kaluza puede leer esta palabra clave, $CYT, y aplicar las preferencias que controlan la visualización de datos e información. Al cargar el primer archivo de un instrumento determinado, se establecen las preferencias para ese instrumento. Posteriormente, el usuario puede redefinirlas según sus necesidades.

Los siguientes vídeos muestran el uso del paquete de software sin conexión del análisis Kaluza para leer archivos desde una gran variedad de instrumentos y proveedores. Los datos se compararon con los gráficos y estadísticas generados en el paquete nativo. Se facilitaron comparaciones en paralelo para comparar su fidelidad.